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苗圃苗木幼苗长势弱、抗性差，容易受到病虫害侵袭，一旦发生病虫害，传播速度快，会导致大量幼苗死亡，影响育苗效益。苗圃病虫害防治要从源头把控，做好基质消毒、种子处理、苗期管护等环节，减少病虫害发生，保障幼苗健康生长。
源头把控关键在基质和种子处理。基质使用前必须进行消毒，可采用暴晒、蒸汽消毒或药剂消毒的方式，杀死基质中的病菌、虫卵和杂草种子，从根源上减少病虫害滋生。种子处理要做好选种和消毒，选择饱满、无病虫害的种子，播种前用温水浸泡、药剂拌种等方式消毒，提高种子发芽率，增强幼苗抗性，避免种子携带病菌导致苗期病害。
苗期管护要做好环境调控和日常巡查。保持苗圃通风透光，控制好温湿度，避免高温高湿环境滋生病菌；浇水要适量，避免基质积水，防止幼苗烂根引发病害。定期巡查苗圃，每天观察幼苗长势，发现叶片发黄、枯萎、有虫眼等异常情况，及时排查原因，针对性处理。对于病害，要及时拔除病苗，集中烧毁，避免传染给其他幼苗，同时对周围幼苗喷洒药剂预防；对于虫害，可采用人工捕捉、粘贴板诱杀或生物药剂防治的方式，减少化学药剂使用，保护幼苗品质。另外，要合理密植，避免幼苗拥挤，减少病虫害传播，定期松土除草，保持苗圃整洁，为幼苗生长创造良好环境。